Obok chirurgów i implantologów najczęściej sięgającymi po badanie CBCT są lekarze ortodonci. Możliwości tomografii wiązki stożkowej pozwoliły na dokładniejsze planowanie oraz zwiększenie przewidywalności postępów leczenia, pozwalając na trójwymiarowy wgląd w struktury kostne szczęki i żuchwy.
Dane anatomiczne, uzyskane na podstawie analizy CBCT, wnoszą istotne informacje odnośnie wymiarów wyrostka czy grubości kości zbitej.